まず、辞めようという気持ちになったら、毎日の仕事のモチベーションが
かなり下がります。そんな状態でボーナスまで頑張るよりも
その会社の就業規則のなかで一番速い日数で辞めるほうがいいでしょう
会社を辞めて、しばらくは束縛から逃れて開放感にひたるのがいいね

すみませんが、うつ病の治療を優先するべきかなと思います。
大学院に入学し、更にうつが悪化したら、それこそ学費が無駄になってしまいますよ。
無事に卒業出来る保証は誰にもありませんが、酷いうつ病を患っているのならリスクが大き過ぎる気がします。

ボーナスは諦めて、まずは治療に専念した方が良いでしょう。

ご質問の日付だとボーナスは冬のボーナスを狙った話ですよね。
夏のボーナスは無い会社ですか。６月支給でもうもらわれたのでしょうか。
さらに、冬のボーナスはもらえそうな業績ですか？
状況によってはもらえない可能性もありますよね。

そして、来年には大学院。
これを考えるとうつ病の改善が必要ですからこっちを重視するなら一刻も早く辞める選択になりませんか？
お金は大事ですが、今のままならそもそも大学院も入学はしたけど通学できずみたいな体調になる可能性もありそうです。

１８０万円あれば、大学院は通学や教材やその他様々な費用も賄えるのでしょうか。
通院費用も必要ですから、残り２０万円では心許なく体調が許せる範囲のバイトや
親ローンを頼む可能性も考えないといけないとは思いますが
ボーナスまで働いたらそもそも進学する気力がなくなりそうなイメージです。