背景がよくわからないのですが、

まずお子さんがいるのですね？
まだ小さいお子さんでしょうか。

奥様も正社員勤務でしょうか？

途中「義父」も登場しますが、どちらかのご両親と同居ですか？
(義父と記載されているので、奥様のお父様でしょうか)

私の感想としては「どっちもどっち」です。

主さんへの感想ですが、話のもっていき方が下手。

そりゃ喧嘩になる。

まず、自分だったらこうするとか、自分だったらこう思うとか、それは横に置いたらどうでしょう？

モヤモヤの元は、その主さんの価値観だと思いますけど。

他の家事も、食事関係のようなスタンスだったら主さんを支持するけど。

手っ取り早いのは、平日の食器の片づけと、週末の昼食の買い出し～片づけを主さんの仕事にした方が良くないですか？
我が家は、私が時短パートだからだけど、普段夫は風呂洗い、子供と一緒に入浴、週１～２のクイックルワイパーでの床拭き、食事の運び＆食器の片づけしかやらないですよ。

よく働くご主人ですね。
ご主人がそうやってやってる間、奥様は何を？

器が小さくもなく、よくやってるご主人だと。
でもどちらも感謝が足りないんだと思います。

主さんの意見しか分からないですが、そこまで夫にしてもらってる奥様って、怠慢？なんて印象すらあります。

私は家庭に限らず、やって貰って当たり前だと思わないです。
きっと奥様はやって貰って当たり前なんでしょう。

主さんがもしいきなり事故にでも遭い、帰らぬ人になったら…
私がしてあげれば良かった…と思うのでしょうか？

私はフルタイムで働いていますが、夫にはそこまでやらせてないです。食事の支度も後片付けも私です。一応、料理を並べるのと、キッチンに食器を運ぶ(2回に1回くらい)のはやってくれます。朝、私が先に出勤する時も洗ってくれます。洗濯掃除は私です。
家の主たる出費を賄ってくれるのは夫なので、それくらいと思ってます。

夫は私の料理をいつも美味しいと感謝し、私は美味しいと言ってくれる夫に喜びを感じまた頑張ろうと思います。

奥様にとって、主さんはなんなのでしょうか。
かけがえのない愛する人ではないのでしょうか？
主さんは、奥様を愛するからこそ家事を分担してされているのでしょう。それに胡座をかいてるのかな？と感じます。
私ならありがとう！と何回も言ってしまいます。
奥様はありがとうと言いますか？主さんは言いますか？

イライラせずに、さらっと頼めばいいかと。
ごめん、これやって！とか。
やって貰ったら、お互いにありがとう！です。
お互いに感謝と尊敬の念がなくなれば、情しかなくなります。

でも奥様、やって貰ってるのに、「器が小さい」は無いわ〜。男の人はどんなに穏やかな人でも女性よりプライドがあります。
男性には言ってはいけない言葉ですね。

トピ主さんが言ってるのは食事関係だけですよね？それを言い出したら、部屋の掃除は、洗濯は、普段の食材の買い物は、育児は、子供の学校の書類の手配は、PTAや自治会の集まりは、全部トピ主さんも半分やっているんでしょうか？（やってたらすみません）

ただトピ主さんの言い方だと、『料理部門のみ』妻に申し訳ないから『仕方なく』片付けはしてるけど休みの日は妻だって料理してないんだからなんとかならないかという主張に聞こえる。結局本気で妻を労いたいんじゃなくて、ただ自分の罪悪感を減らしたいだけ？となってしまいます。

妻から見たら、料理以外に関しては申し訳なく思ってないの？となるんだと思います。そりゃあ怒るかなあ、と。

第三者から見ても、申し訳ないけど
料理の代わりに片付けしてやってるんだから（恩着せがましい）、料理をしない時は妻が片付けをしろ、と言っているように聞こえてしまいます。

トピ主さん自身の罪悪感を帳消しにする為のお手伝いじゃなく、もう少し素直な感謝の心で妻を労ってみては？

愛情ですよね。

奥様は、もうあんまり主さんに愛情がないのかな。
別に嫌われてもいいや、って思ったら、ギブアンドテイクはしないでしょ。

私は夫に嫌われたくないし、大好きだから、してもらったらそれ以上を返そうって思う。
でもそうしないのは、やっぱり「どうでもいい相手だから」かなあ。私ならそう。

ご飯作るのは、ギリギリ子供のこともあるからね。
でもそれ以上は、普段自分がしている程度のことを主さんがしていなかったら、お返ししたいと思えないのかもね。
主さんはご飯のことだけに焦点を当ててるけど、ほかの家事育児についてはどうなんだろう？
奥様の中で、ほかの家事育児で主さんとイーブンじゃなかったら、食事の片づけくらいいつでもやれよってなる。
買ってきただけでえらいのなら、他の家事してる自分は？ってなるもんね。
そこはどうなんだろう？

そういうのの積み重ねで、奥様に主さんへの愛情が薄れてきてるのかもしれない。
名前のない家事ってたくさんあるの、知ってます？
そういうの、やってます？

不快に思われたら悪いのですが、
その程度で喧嘩になることが理解できません。
それにはルールが必要なのでしょうか？

私は水周りが汚れていると落ち着かないので率先して片付けをします。
妻は片付け前にキスしてくれたり、私が皿洗いしている側に近寄って褒めてくれたり、とても可愛らしく立ち回りますよ。
惚気に聞こえるでしょうが、うまく妻には操縦されている次第です。

夫婦でライバル関係になり、些細なことで感情的になっていたら日々の生活において疲弊してしまいませんか？
もっと大事な時のために体力は温存しておいた方が賢明です。

損得勘定ではなく、お互いに尊重し合える関係性を維持することに神経を使った方が楽じゃないかな〜って思います。

この件では、お互いにパートナーへの接し方が雑としか言いようがないです。
丁寧に立ち回ってみて下さい。

あまり、どっちがどうとか損得みたいに考えないようにした方がいいと思います。

が、でもまぁ、買ってきてくれたのなら私なら自分が片付けはします。
奥さんの言う、「捨てようとは思わない」ってテイクアウトの食べた後のゴミのことですかね。

ここを読んで、なんというか、可愛くない奥さんだな、と思いました。
そして、ゴミなのに「捨てたくない」っていちいち考えて行動することでしょうかね。

喧嘩して無視することも、ままありがちですが、一ヶ月も話さないなんて、それもどうだろう。
お互い様な所もありますが、意固地な奥さんですね。

＞妻にそう思わないか？と問うと、妻は、同居している義父は、すててくれるし私は捨てようとは思わないと言います。

この一文の日本語がさっぱりわかりません。
いきなり義父が出てきて、結局妻がなんと答えたのかもよくわからない。
義父って誰？あなたから見て義父？
それとも妻から見て義父？
なんの話なのか？
すててくれるし、って何を捨てるの？テイクアウトのゴミ？
私は捨てようとは思わないって、私って誰？妻？
そもそもこの一文の状況がよくわからない。

で・・・どっちが片付けるのか？という話ですが。
自分で食べたものは自分で片付けろ！と思います。
あなたが買いに行きました、みんなで食べました。
じゃあ食べたあとのゴミは各自が捨てる。
食器も、各自がすすいで食洗器に入れる、でいいじゃない？
何がダメなの？
子供が小さくて出来ないなら親がするしかないですけどね。

あなたは、奥さんが料理してくれたときは洗い物を自分からすすんでやろうと思うタイプ。
片付けまでさせては申し訳ない、と感じるからと言ってますが、それはあなたの感情です。
奥さんはそういう考えはもってないんですよ。
出来る人がやればいい、と思ってるんでしょう。

あなたも料理するからわかると思いますが、料理することと、食器を洗うことを比べるのっておかしいと思うんですよね。
料理は、そもそも食材を買ってこなくちゃいけないし、献立も考えなくちゃいけない、メニューによっては時間もかかる。
食洗器を使うなら時間もそこまでかからないし、手荒れもしない。
あなたと奥さん、どちらのほうがキッチンに立ってる時間が長いですか？
あなたは、一方が準備したら、もう一方が片付けをする、と考えてますよね？
これでチャラだと。
私にしてみたらこれじゃチャラにならないです。
料理１回＝食器洗い２～３回　くらいですね。
手洗いなら同等かなと思うけどね。

主さんの「ご飯を準備してもらったら片付けは自分がする」っていう考え方は、相手を思いやる素敵な考えだと思います。ただ、いきなり「食材を買ってきた方に片付けまでさすのは申し訳ないと思わないか？」と言われたらカチンときます。
休みの日のランチ、楽しく食べていたのに台無しになるな。
言い方を「これまとめて捨ててもらってもいい？」とか「テーブル拭いといて」なら「いいよ」と答えられそうですが、「申し訳ないと思わないか？」って凄く喧嘩腰じゃないですか？
主さんは「準備していないほうが片付ける派」だけど、奥さんは、片付けは誰がしてもいいと思っているんじゃないかな？思いやりなどは別として。
いっそ主さんの家では「食事準備していない人が片付けるルール」に固定してしまえばいい気がしますが。

何にせよ、ずっとモヤモヤしていたことをまとめて爆発させる様なやり方ではなく、「食事は買ってくるから、片付けよろしくね」ってサラッと伝えてほしいな。

ちなみに我が家ではそんな事では喧嘩になりません。気づいた方がやるし、私が主さんの立場で、片付けをやってもらえなくてもイラッともしないし、美味しかったね、で終わりです。

まず、”申し訳ないから食事の後片付けをする”と言う考え方を変えませんか？
自分に引け目があるから物事をする考えでは必ずストレスが溜まります。
後片付けと言っても食洗機で洗うのならほとんどやることがありませんよね。
食べた後のテーブル拭きとか子供の食べ残しの片付けとか何時間かかりますか？
何もしない旦那と比べたら、少しは家事のようなことをされていますが、その程度で不満の原因になるのならやらないほうが賢明です。
不満とは相手の落ち度に対して感じることで、例えば乳児がいるのにテーブルの上に包丁を置きっぱなしにするとか、気が付かなければ大事故になることは強く注意していいと思います。

結婚されて10年も経てばお互いの立ち位置が確立されています。今更奥さんを自分の思う方向に動かそうと思っても時すでに遅しです。