時期が時期ですから、親御さんに対してもうがい、手洗いはきちんとするようにお願いするのは全く問題ないと思います。

ただ個人的感想としては、どちらかと言えばトピ主さんの行為の方が潔癖症にも思えますね。新居とのことなので、奇麗にしておきたいのは分かりますが、やや神経質に感じます。もちろん、自宅でのルールであれば他人が口を挟むことではありませんが、これが習慣になってしまうと、「汚い」家の外で過ごすのが大変だろうなと。
たぶん実際の健康に対するリスクをきちんと評価すれば、それほど神経質になる必要はないように思います（たとえば新型コロナの純粋な接触感染による感染リスクは極めて小さい）。まぁ、余計なお世話ですが。

2くらいかな

3はハンドソープでは手を洗って欲しいけど、先にカーテン閉めるとかは全然気になりません。

どとらかと言えば親御さん派です

しいて言えば
１番は嫌だなと思う人がいても理解はできなくはないですが
（リビングに持ち込むと言うよりは、
カバンをそこに置くことに問題があるとは思うけど）

ただこれ、車が必須の田舎に住んでいますが
買い物などの袋とか確かにそこにおいてしまったりしてました

３番も今はコロナの影響もあり
気持はわかりますが、
それを言ったら家のドアノブなんかも触れなくなってしまいますよね？

それに私はどちらかといえば
衛生仮説支持派、最近の除菌のしすぎはどうなの？
という感じだし
多分親御さんに近い世代だと思うので、ちょっとぐらい平気よ
というかむしろそれで免疫が付くものもあるよね
といった考えがあるのでそこまでしなくても・・・・
とはおもいます

（まあくれぐれも最近はコロナのことがあるので
　一概には言えないとは思いますが）

３については
私もお風呂は基本１日おき
夏場など汗をかいたり何か特別汚れるようなことをしたら
シャワーとかはしますけどね

あと

＞帰宅後まず、鞄などは玄関近くに置いて、部屋着に着替えるか
＞外から帰ってきた服でカーペットに寝っ転がられたり、
＞ソファに座られることがとても苦痛なのですが
これはちょっと潔癖すぎではないかな？とは思いますよ

だって、じゃあご両親だけじゃなく
友人なんかも家に呼べないですよね？
それこそベッドは嫌ならまだ理解はできますが
カーペットやソファーまで嫌というのはちょっと困りませんかね？

でもこれ、義理の親と合わないとかならわかるのですが
実の親ですよね？なのにそこまで合わないのは
逆に不思議です
まあ親御さんに育てられたトピ主さんが
今まで何の支障もなく生きてこれたのだから
そこまで神経質にならなくてもいいんじゃないかなぁ～
とは思いますよ

還暦過ぎのおじさんですが、1.2.3どれも気になりません。
「私としては外から帰ってきた服でカーペットに寝っ転がられたり、ソファに座られることがとても苦痛」
朝服を着たら寝る時まで同じ服ですから、部屋着なんて有りません。
それでも60年以上感染症に掛からずに生きています。

コロナのせいもあるでしょうが、新築の家だと神経質になりがちなのかもしれませんね。
お子さんも小さいし、家族と家を守る責任感でいっぱいになっているように感じました。
家はあなたのお城なんですから、安心できる場所であってほしいですね。
気持ちが少し落ち着くまで、ご両親とは外で会ったらどうですか。
あなたを育てた親ですから、気性は誰よりもわかっています。
伝え方さえ気をつければ、理解してもらえると思いますよ。

何度か読み直しての感想。どっちもどっち。可愛く表現すればドングリの背比べ。

気になったのは、家の中と比較して外の世界が汚いとお考えなところ。
何をもって汚いと考えるかによって答えは違ってきますが、ダニ、ノミ、カビ、ウイルス、有害な化学物質その他、屋内外でどれほどの違いがあるのでしょうか。
精密機械や半導体工場、病院の手術室、入院用無菌室、最近研究室等と違い、どんなに清潔にして外部と分け隔てていようとも、穴だらけです。
自宅内が外よりキレイ、外が汚いというのは、衛生管理上あまり根拠がない思い込みのように思います。

家に帰ったらまず石鹸での丁寧な手洗い、嗽（うがい）は当然と思いますが、かばんをすぐに持ち込まない、まずシャワーで汚れを落としてから他の生活空間に入ることに、合理性はないように思います。ウイルス除去を謳う空気清浄機もありますが、決して室内を漂うまたは服などに付着したウイルスや細菌を滅菌してくれるものではありません。そもそも外気が自由に出入りする環境で、空気中のウイルスを空気清浄機で駆逐できるはずがありません。

意識は大切です。しかし不要なこと、差が生まれない努力をするのは、もっと他に割けるエネルギーを無駄に使っているのと同じです。