トピ主さんがその後輩と友達でいたいと思っても、後輩がトピ主さんに恋愛感情を持ってたら友達でいるのは無理ですね。
取りあえず、２人で食事をしたり出かけるのはやめて、SNSでのやり取りも減らしましょう。

あとは、好みのタイプ（その後輩に当てはまらない人物像）を伝えるとか、気になってる異性の話を出すとか、今は恋愛に興味がないとか、そんな感じで「好みのタイプじゃないよ」とか「異性としての興味はないよ」というのを伝えてみる。
まあ、伝え方によっては相手を傷つけてしまうので、普段の何気ない会話の中で伝えるとか工夫は必要です。