やはり現地の情報を手に入れるのが一番でしょう。
参考までにサイトを。
http://www.ny.us.emb-japan.go.jp/jp/j5/p01.html

ちなみにニューヨーク市の2006年の殺人は590人（人口820万）。
参考までに東京都では143人（人口1220万）。
人口10万人当たりで見ると単純に件数では数倍といった程度ですが、強姦や強盗も含めると数十倍に跳ね上がります。
まあ、上記のようなことや地区別の発生件数についても載っているので参考にはなるでしょう。

概して日本の常識で行動しない方が良さそうです。
軽犯罪に関してはそれほど格差が無い部分もありますが、凶悪犯罪に関しては人口当たりの件数が比較にもならないことがザラなので、現地を知る人からも情報を集めた方が無難だと思います。
寸借詐欺で5ドル頂戴されるくらいなら笑い話で済みますが、そうでない場合は大変ですからね。

数年前に初めて訪れてから年に２度くらい一人で行くようになりましたが、タイムズスクエアは１２時近くでも結構人が歩いていますよ。
金曜や土曜などは更に人がいっぱいです。
私の場合は大抵一人での行動なので（大体ですが）夜１０時過ぎには地下鉄には乗らないようにしていました。地下鉄には乗らなくても１１時くらいにブラブラと５番街を歩いていましたので、ただ単に地下鉄に乗らないようにしていたというだけかもしれませんが。
どうしても西に行く時、（西側は）夕方になると一気にさみしい雰囲気になってしまうので真っ昼間にだけ行くようにしました。
遠いところは昼間のうちに、ホテルの近くは夜にでも見て歩いたらいかがでしょうか。
　ちなみにマリオットマーキース前の路上はは昼も夜も賑やか！ミュージカルなども大抵歩いて行けますし、とてもいい場所だと思います。
お部屋のことはわかりませんが、お寿司のランチは結構おいしかったですよ。
　今も昔も危険な地域はありますし、危険な状態になってしまったら日本の比ではないことは変わらないと思いますので、その心構えだけは以前ご旅行された時のままでよいと思います。良い旅を！

在米で、時々NYに行きます。NY在住の方ほど詳しくありませんが、私の印象をお話したいと思います。

NYはあちこちに観光客がたくさんいます。特にタイムズスクエア、ロックフェラーセンター、エンパイアステートビル、自由の女神などの周辺は、地図を片手に、カメラで写真を撮り合っている姿をよく見かけました。そういう地域でしたら、凶悪犯罪の恐れはあまりないでしょう（スリなどはいるかもしれませんが…）ガイドブックに載っているようなエリアを散策される限りは大丈夫だと思います。タイムズスクエア周辺は夜でもかなりにぎわっています。

でも、上のレスの方もおっしゃっている通り、日本とアメリカの犯罪率の違いは大きいですよね。用心するに越したことはないと思います。夜の地下鉄、女性だけの夜歩きは避け、人気のない通りは昼間でも注意したほうがいいでしょう。力ずくのひったくりに遭ったという話も聞いたことがありますので…高級ブランドのショッピングバッグなんかを持っていても標的にされるかもしれません。地味な格好の方がいいかもしれません。

NY、楽しんでいらしてください。

アメリカの町は、基本的に日本のそれと治安考え方が違うので、
どこであっても「安全だ」とは言い切れません。ただいわゆる
わかりやすい意味での危険さはNYCには今はないです。

誘拐や暴力や麻薬や売春、路上でのすり・恐喝の類は
確かに昔より減っています。しかし日本での通り魔同様
巻き込まれたらば、たとえそれが滅多にない事件であったとしても
本人たちには深刻な被害なわけで、滅多にそういうことが
ないからといって危険ではないというのも変な話。
用心するに越したことはありません。

・ひとけのないところには行かない、近寄らない、紛れ込んだら抜けでる。
・その反対に、やたらと雑踏でごった返していて道路や壁、店が汚い地域には寄らない。
・「安い店」には、慣れるまで近寄らない。
・話しかけてくる人を絶対信用しない。たまたま会った日本人とかを「友達」などと絶対考えない。
・タクシーはどこででも拾えるとは思わない。タクシーに乗りたければ道をうろうろするのではなく、飛び込んだホテルのフロントでよんでもらいましょう。
・財布はなるたけ人前に出さない。使いそうな分お札は別に持ちます。

３年前まで住んでました。昨年久しぶりに遊びに行ったら「NYってこんなに汚くって怖かったけ...?」
日本から来るとやっぱりとても汚くて怖い所ですね。当時住んでいた時は慣れてしまって気がつかなかったけど。

・マリオット・マーキー前は賑やかで人通りも多いので夜も１２時くらいまで外出OK。週末は夜通し大丈夫。ただし8Aveから西には夜は行かないほうが良い。
・チェルシー周辺は平日は人気がないので休日の昼間に行く事。
・地下鉄は路線と時間帯と場所によって夜中でも大丈夫だったり昼間でも危なかったりするので一概には言えない。どこに行く予定か示してくれればアドバイスできます。
・買い物は明るいうちに。ショッピングの紙袋をもったまま食事などに行かず出来るだけまめにホテルに戻って置いてくる。もしブランド店でお買い物をしたらすぐにGAPやH&Mなどの紙袋に移し変えてホテルに直行する事。
・路上や地下鉄で知らない人に声を掛けられたら無視して遠ざかる事。
・スリが多いので出きるだけ両手がフリーになるよう常に荷物を少なめにする事。
・地下鉄は車掌のいる車両に乗る事。

こんなところかな？

観光客が行くような大抵の場所はあまり心配しなくて良いと思います。
ただ、このストリートをはさんで・・・、ということはあるので、逆に、行く予定の場所をきちんと書いた方がレスが付きやすいのではないでしょうか？

今思いつくところでは、West Side（セントラルパークより西側）は125stより北は行っては行けません。セントラルパークの真北及び東側は110stあたりまででしょうか。○から西と言っても、Upper West Sideは特に問題ないと思います。住んでたときは良く川沿いを散歩してましたよ。日が暮れてからは公園に入るのはやめましょう。

タイムズスクウェアなら、私なら0時までOKですね。地下鉄は1,9,2,3ラインは人が多いので私的には夜中まで大丈夫です（おすすめはしません）。他のラインなら一人なら22時以降は避けて、タクシーを使います。数人なら23時くらいまでは乗るかな。

ただ、「大丈夫」と書きましたが、住んでる人間にとっては大丈夫でも、観光客には大丈夫でないこともあります。見れば大体観光客がどうかわかるので、やはり観光客は狙われやすいと思います。

タイムズスクウェア周辺のカメラ屋には気をつッましょう。高いものを無理やり売りつけようとすることがあります。「お金がない」というと、「クレジットカードで良い」と言われ、怖そうな男の人に周りを囲まれ逃げられなくされます。私の友人の例です。彼女はNYCに住んでいたのですが、カメラを買うことを検討していて値段を聞きに気楽に入ったそうです。危ういところで逃げたそうですが、気をつけてくださいね。

やじろべえさん、ゆりっぺさん、とうふさん、ろいひんさん、SUNUさん、具体的な情報をありがとうございます！

「話しかけてくる人を絶対信用しない」
「知らない人に声を掛けられたら無視して遠ざかる事」

なるほどー、安全になったとはいえ、やはり警戒は必要なんですね。なんだかドキドキしてきました。ハーレムやブロンクスなどにも足をのばしてみたいと思っているんですが、昼の間にしたほうがよさそうですね。
ホテル近辺は比較的安全そうなので、ちょっと安心しました。でも、やはり夜の地下鉄は日本のようなわけにはいかないですよね。夜、レストランなどからホテルに戻るときには、タクシーを利用したほうがよさそうでしょうか…。
気をひきしめつつ、めいっぱいエンジョイできるといいなあと思っております！

ハーレムに何しに行くのですか？？？

West Sideの125st上なら昼間なら歩いても大丈夫だろう（保障はしません）と思いますが、それより北は昼でも絶対やめましょう。また125st上でもあまり東側は行かない方が良いです。上でも書きましたが、セントラルパークの北は110stを越えるともう危険地帯です。

ニューヨークが安全になったとは言え、危険なところは危険です。ハーレムも昔より良くなったとは聞きますが、以前は危なくて歩けなかった125st上が昼間なら歩けるようになった、という程度ではないでしょうか。ハーレム内部も若干良くなっているらしいですが、いずれにせよ観光客が行く場所ではないです。付近の住民も、125stより南側に住んでる人間は、125stを越えてハーレムに足を踏み入れることはありません。125st上でも歩いててあまり良い気持ちはしないですよ。

ジャズを聞きに行ったりするのかもしれませんが、日本からの格好そのままで行くなら、タクシーを使った方が無難ではないかと、私は思います。

ブロンクスも場所によるようですが、私は詳しくないので。気をつけて良い旅を。

かなりやばいところだという事、ご存知ですよね??
ブロンクスには「ヤンキースの試合を見にヤンキースタジアムに行くだけ」と言うのならわかりますが、それでも安全そうな他の観客の集団に必死にくっついて行って絶対寄り道しないで下さいね。ゲームの無い日は近寄らない方が無難です。

ハーレムもできれば何かツアーに参加して行ったほうが良いと思います。
確かにBroadWayから入ってWest Sideの125stなら無事かもしれないけど、知らずに後をつけられていてあとで狙われるという事もあるのでお気をつけて。

ちなみにタイムズスクエアだって100%安全ではないのですよ。比較的安全というだけです。通勤で毎日42stを歩いていましたが、ライオンキングの前辺りで、沢山の警察官と捜査官に捕らえられている男性を見た事があります。まだ日の明るい夕方の通勤ラッシュの時間でした。タイムズスクエア周辺なら警察官が沢山居るので何かあったら助けてもらえる（かもしれない）けど、ブロンクスやハーレムでは誰も助けてくれないしヘタしたら殺されるということを念頭において行動して下さいね。