離婚協議中とのことですが、これからも（離婚後も）トピ主さんがお嬢さんを扶養することにご主人は同意している、ということでよろしいでしょうか？

私からは、以下の２点を提案させていただきます。

１．トピ主さんもお嬢さんも、国民健康保険に加入する
２．現在お勤めの会社の健康保険を、任意継続にする

まず１番ですが、国民健康保険には、扶養という概念がありません。保険証を使う人すべてについて、保険料が掛かります。つまり、トピ主さんとお嬢さん、２人分の保険料を支払うことになります。

次に２番ですが、現在お勤めの会社で、継続して２ヶ月以上勤務（健保に加入）している場合、退職後も引き続き、その健保に加入（最長２年）することができます（＝任意継続）。家族を扶養に入れることもできます。

ただし、在職中の保険料は、会社と従業員（トピ主さん）が折半して負担していますが、退職後の任意継続では、保険料は全額、トピ主さんが支払わなければなりません。

１番と２番、どちらの保険料が高いか安いかは、一概には言えません。事前に、担当機関、担当部署へお問い合わせください。
（続きます）

（続きです）
健康保険では、夫と妻、両方に収入がある場合、どちらが子供を扶養するかは、保険者（保険の運営元）の判断によります。

原則として収入の多い方の扶養に入れる、という基準のところが多いようですが、それ相応の理由があれば、収入の少ない方が扶養することも認められる場合があるようです。

また、収入の多い少ないに関わらず、住民票上の世帯主の扶養に入れる、という基準を設けているところもあります。

仮に、離婚成立前に再就職が決まった場合、ご主人の収入の方が多かったり、ご主人が住民票上の世帯主であるときは、再就職先の健保から「なぜ子供を夫の扶養に入れないのか」という照会があるかもしれません。その際は、現状を説明する必要があるかと思います。

もちろん、最終的に扶養を認めるかどうかは、保険者がそれぞれ設けた基準により決定するので、ここで断言はできません。ただ、近年、夫婦のライフスタイルが多様化していることを踏まえ、柔軟に対応するところも増えているようです。

＞私も娘も主人の扶養に入らないといけないのでしょうか

扶養というのは「入ることができる」というニュアンスのものです。
強制ではありません。
つまり、トピ主様がご主人の扶養に入りたくないのであれば、現在の健康保険の任意継続被保険者になるか、国民健康保険の被保険者になればいいのです。
こういう事はあまり悩んでも仕方ないので、社会保険事務所に直接聞いた方がいいです。
国保に入るとしても、保険料を計算してもらった方がビックリしなくて済みますからね。
（国保は高い！！）
その際、ハッキリと
「離婚予定なので私も娘も夫の扶養に入りたくない」
「すぐに働く意志がある」
と、この２点を言った方がいいです。
漠然と「夫の扶養に入りたくないんですが・・・」と言ったら困惑する担当者もいると思いますので。

念のため確認なのですが…、今トピ主さんがお持ちの保険証には「○○社会保険事務所」と記載されていて、お電話されたのも、その社会保険事務所で間違いありませんね？

確かに、窓口の担当者によって、微妙に回答が異なる場合もあるようなのですが…、おそらく会社の方は、「父親は会社勤めをしているのに、退職後も母親の扶養に入れていいか」という切り口で、問い合わせたのではないでしょうか…？

基本的には、被扶養者の状況（お嬢さんの収入の有無）に変更が無ければ、引き続き扶養に入れられると思うので、会社の方には、
１．現在も離婚後も、お嬢さんを扶養するのはトピ主さんであること
２．ご主人とは既に別居していて、世帯が完全に分離していること
の２点を踏まえ、もう一度問い合わせてもらえないか、お願いしてみてください。

もしくは、任意継続は自分で手続きすることも可能です。ただし、退職後２０日以内に行わなければなりません。手続きの際は、在職時の保険証の「記号・番号」が必要となるので、会社に保険証を返す前に、コピーを取っておくといいかと思います。

まず、社会保険事務所が管轄の健保は「政府管掌健保」です。
お手元の健康保険証に「○○健康保険組合」みたいな名称でしたら問い合わせ先が違う可能性があります。(○○は会社名や業界名が入っている事が多い。)会社の方が問い合わせしているので、間違ってはいないと思いますが念のため確認してもいいかも。

ちなみにうちの健保でしたらトピ主さんの場合、問題なく任意継続出来ると思います。
娘さんが成人している(自分で働ける年齢)だとまた違って来ますが。
携帯からなので、簡易にまとめてしまいました。分かりづらかったらごめんなさい。