しかもなんで奥様開き直ってるのでしょう？
他人の子を扶養する義務はあなたにないと思いますが・・

別居してたのだし、もう離婚されたら如何でしょう？
中学生の子供には、自分で将来を選ばせましょう。
母と暮らすか、父と暮らすか。

なんとなく、どちらも不甲斐ない親のような気がするので
不憫ですが・・。

がみさんへ

ずばり離婚すべきでしょう。”浮気はあなたが私を大切にしなっかったから、、、”　そんなの理由にも何にもなりませんよ。浮気は浮気、浮ついた
行動の結果です。御幣のある言い方を敢てします。自分は今ニューヨークに
居住していますが、失礼ながら日本でアフリカ系の子供を育てるのは、想像以上に大変なのでは？　ニューヨークならそんな事は別に大した問題ではありませんが。あなたもそのお子さんも、近い将来やって来る問題に対処する覚悟が必要と思いますが。
もし自分があなたであったなら、どう考えを廻らしてもあなたの奥さんを
許す事はできません。これはあなたに対する裏切り行為です。
恐らく多くの異なるレスが届くと思いますが、あなたと２人の娘さんの事を優先して事に当って下さい。よし。

「婚約者が元彼の子を妊娠」
http://komachi.yomiuri.co.jp/t/2009/0424/236366.htm?g=04

でも、トピ主さんの場合は、お嬢様達がいらっしゃる。もっと深刻ですよ！
子供にとって親の浮気は、どちらの味方をしていたとしてもとても辛いものです。

携帯なので見えないかも知れませんが、法律相談に行って「嫡出否認調停」について調べたほうが良いと思います。

普通は離婚問題に発展しますが、文面からは離婚ではなく顔が違う子供を育てていく事を悩んでいるように感じられました。明治時代、夫が愛人との間に出来た子供の世話を本妻にさせるの、現代版、逆バージョンですね。
ぜひ、弁護士などに相談してみて下さい。その子供を戸籍に入れない方法、自分が父親になるのを回避する方法。だって、もし後々離婚とかになった場合、妻が浮気して作った子供の養育費を払わされる羽目になったりしたら、それこそバカバカしいじゃないですか？？

なんでここで聞くのかな?
どうすればいいでしょうってどうしたいの？

別居中の妻のことがそれだけ心配なんだったら
別居解消してやりなおせば？

　娘さん連れてにげろー
　別居してたんでしょう？？
　逃げてあたり前。
　
　その後、エイズ検査を受けましょう。
　

奥様はとぴ主さんが悪いからと言っているそうですが、浮気したのは奥様です。別居中に浮気して、妊娠したからトピ主さんに責任取ってなんて、奥様もとてつもなく勝手な事を言ってますね！
夫婦間で納得して、自分達の子供として育てるのは良いとしても、明かにトピ主さんの子供でないという事が周りの人には一目瞭然になるわけですから、近所や学校での噂や虐めの対象になるし、勿論、ご夫婦間に今いるお子さん達にも虐めは有るでしょう。
夫婦の子供として育てるには、どちらの子供も苦しめる事になります。

子供達に罪は有りません。奥様に自分のしてきた事は自分で責任を取るべきだと思います。

４ヶ月なのに中絶不可能・・何か事情がおありでしょうか。

奥さんの発言は矛盾しているというか、同じ女性の私が聞いても「は？何言ってんの？」という感じです。
旦那さんに大切にされていないと感じる、女性として見られていないと感じるのは辛いことでしょう。それはわかります。
でも、心の拠り所としてわかってくれる相手が現れたならまだしも、そこで「行きずりの相手」。旦那さんが大事にしてくれなかった自分を、一番自分が大事にしてない。

別居状態だったなら、認知しないで離婚するという選択肢はないのでしょうか？経済的に厳しいですか？でもそれは奥さんが自分で背負うべき責任だと思います。中学生、多感な時期であるお子さんたちはどう感じているのでしょうか。別居原因が主さんの浮気、とかなら母親の味方になることもありえますが、そうでないなら浮気相手の子を妊娠、しかも産むなんてありえないと思うんですが。

奥さん、辛いなら何をしても許されるのか？
決してそんなことはないはずです。人間として、一人の母親として。主さんが育てる謂れはないと思います。

混乱してらっしゃるのは想像できますがどうしたいのかが書かれていないのではどうともアドバイスしようがないですよ？

・ご自分の子として育てられるんですか？

その1点をまず考えて
結論を出されればおのずとどうすればいいのかは決まるのではないでしょうか？

どういう状況で別居状態だったかどうか知りませんが。
貴方にはその子を自分の子として育てるつもりは全くないのですよね？

しかし婚姻状態で妻が出産した場合その子は貴方の子としてみなされてしまいます。大至急、金に糸目はつけず弁護士に相談にいかれることをお奨めいたします。