両方数年前の夏に行きました。サントリーニは素敵です。有名な夕日はもちろん街並みも素敵です。ただ、ビーチの砂が白砂でなかった事がイマイチ…。ミコノスは絵葉書のような島でした。白砂のキレイなビーチでパラダイスやスーパーパラダイスではさすがの海の透明度。ミコノスからデロスへ船が出ていますので遺跡も楽しめますよ。

今年のゴールデンウィークにミコノス島に行きました。街並みはとてもきれいで感動したのですが、とにかくめちゃくちゃ寒かったです！
日本の春よりは少し暖かめの衣服をご用意されることをおすすめします。

両方行ったことありますが、どちらかひとつなら私はサントリーニをおすすめします。ミコノスは、わりとなだらかな島なのですが、サントリーニは島に起伏があるので、景観はこちらのほうがよかったです。すぐ目の下に真っ青な海が広がっていて、家並みも段差があるので綺麗です。イアという街が落ち着いていてよかったですね。（ここから見る夕日は美しいと評判です）町の中心から各方面にバスが出ており、ビーチでも遺跡めぐりでもできますし、島から近隣の火山島へ行くツアーもあります。ただ私が行った時期は、６月のシーズン中だったのでバスも本数があり、ツアーも毎日催行されてましたが、春先ですとそのあたりはどうでしょうか。６月といえども、日中は暑くても夕方は海風が強く肌寒かったです。
アテネから行くのであれば、ミコノスのほうが近いですね。お店は、春先はまだ半開きぐらいかもしれませんが、どちらの島へ行ってもギリシャらしい味わいがあります。じっくりご検討ください。
なお街中では、英語でほとんど通じました。

数年前に、ミコノスからサントリーニをまわりました。
似ているようでも、全く雰囲気が違います。
町をぶらついた雰囲気はミコノスのほうが楽しいと
おもいますが、サントリーニの絶景は（私は）
カルチャーショックを受けるほどでした。
感激度はサントリーニだと思いますが、是非　両方へ
立ち寄られることをおすすめします。
私達もそのために、アテネ観光は減らしました。
でもそれ位、価値があると思います。
ちなみに旅行代理店が、船便は不安定だからと
サントリーニは勧めませんでした。