お返事が遅くて申し訳ありません。
　ビーフシチューさん、オバさんさん、chickpeaさん、wowさん、ありがとうございます。
　本当は個別にお返事するところですが、内容が重複するのでまとめます。

「返事は出さずに年明けに寒中見舞いを出すのが一般的」
　そうなんですね。
　お返事（喪中見舞い）を出したのは、寒中見舞いは年明けに出す、と言うのが引っかかったからです。
　年賀状のやり取りをするだけの間柄なら寒中見舞いを選びますが、たまに顔を合わせたり、その後も年内にメールや電話をしたりもするのに、ハガキの返事を出さないのはなあ……、と気になって。
　メールで「ハガキ届きました。了解です」と返信するのも考えましたが、相手が喪中欠礼を下さったのに返事がメールじゃ失礼かなって、ぐるぐる考えてしまいました。
　受け取った事をメールで伝えた上で、改めて自分の言葉での寒中見舞いを出す方がよかったかもしれません。