男性が女性の容姿について本人に言うと
セクハラって言われますよ。
たとえ内容が
『痩せたね～』だったとしてもね。

それならば、
性別が逆でも同じです。

『痩せてかっこ良くなった』は性別を変えると
『痩せてきれいになった』ですよね。
これ、嫌いな上司に言われたら、
『あの人、そういう目（性的な意味合い）で私を見てる』と
思われかねません。
実際、そう思われたから相手も被害を訴えたのでしょう。
しかも何度か言ってるんですね。
一回だけなら相手もスルーしてくれてたかもしれませんよ。

体型・容姿に関する事は
セクハラ認定されやすいです。
肩もみだってセクハラな時代ですからね～。
（私は肩もみだったらセクハラ目的でもして欲しいぐらいですが）

抗議する＝これからもセクハラする
というようなものですよ。
静かに反省するのが得策かと。

積極的な姿勢を褒めるなら、
抽象的に言わず、はっきりと、『積極的でいいね』と褒めましょう。
もしくは、仕事上で褒めては？

意中の人にほめられたら気分はいいけど、対象外の人に言われたら気分悪い

とか

上から目線でムカつく

とか

容姿を言われること事態気分良く思えないから注意してほしいのかもしれないし…
イヤだと思う人がいたんだから、今後注意すれば良いのではないでしょうか

女性が加害者になることは少ないだとか、積極的にほめただけだとか、勝手な仰りようだと思います。
言われた本人が不快ならば、それはセクハラです。
世のセクハラの統計がどうとか、トピ主さんの意図がどうとかは関係ないのです。
なにを不快に思うかは人それぞれだし、職場は仕事をする場所ですから、体型についてあれこれ評価する必要はありません。
少しでも多くの人が嫌な思いをしないで仕事ができるように、職場の環境を良好なものにしなくてはいけません。
ましてや、部下に当たる人は、直接抗議したり拒否したりは困難です。
セクハラという言葉の響きは重いですが、小さなことでも改善していかなければなりません。

別にまだトピ主さんが処分を受けたわけではないのだから、からかう意図はなく、嫌がっていると気付きませんでした。気をつけますと言って態度を改めるだけではないですか。
抗議する筋合いも必要性もありませんよ。
ここで抗議するような態度を取ると、処分や不利益な取扱いに繋がることになると思います。

最後に、トピ主さんの会社は、配慮の行き届いた素晴らしい会社だと思います。

セクハラだと取られますよ。

トピ主さんのＦさんへの発言がセクハラかどうかについてですが、私はセクハラになるのではないかと思います。
トピ主さんは、男性上司に「昔は太っていたのに、痩せて美人になったね～」などと言われても平気ですか？不快に思いませんか？
体型やダイエットの話は女性はNGで、男性はOKという事はないと思います。
他意や悪気はなかったのでしょうが、そういうのが一番厄介だって小町でも話題になりますよね。
反省はしても抗議はするべきじゃないと思いますよ。

＞女性がセクハラの加害者になることはほとんどあり得ませんし、
　セクハラの定義に男女の区別は無関係です。
　女性でも当然セクハラの加害者になる可能性があります。

＞このケースでは私は積極的な姿勢を褒めた訳ですから、これがセクハラなんて全然納得がいきません。
　褒めようが貶そうが業務に無関係の容姿に対するコメントは、
　本人が不快に思う以上立派なセクハラです。

　業務に支障がない限り、個人の外見に関するコメントは控えるべきです。
　　身長・体型・頭髪・顔　等全て不可

＞こういう場合、本人や課長、会社に抗議できますか？
　何を抗議するのですか？
　貴方は、今後は『男性の容姿についてからかうような発言』をしないように
　注意すればいいだけです。

　人事権は会社にあります。
　下手なことをして睨まれたら、今後の評価や昇格に響くと思いますがいかがですか。

例え女性であってもセクハラの加害者になりますし、容姿を褒めるものであってもセクハラになる可能性はありますよ。
セクハラは受け手側がどう思うか、が重要です。
例え純粋に褒めているつもりでも、相手方が容姿の話題をされて嫌だと思えばセクハラになり得ます。

主さんだって、上司が「ミハルさんは本当にナイスバディだよね。胸の形もきれいだし、腰もキュッとくびれているし、不二子ちゃんみたいだよね。」
って言ってきたら不愉快じゃないですか？
その上司が悪気がなくて、純粋に主さんを褒めたとしても不愉快じゃないですか？

「痩せてカッコよくなったね、良かったね」は、裏を返せば
「今まではブクブク太ってて残念極まりない容姿だったよ。」と言っているのと同じです。
F君がそれを不愉快に思ったのでしょう。

上司の立場になったら、褒めているつもりでもそうは取られない可能性を自覚して、容姿の話はしないことです。

女性がセクハラされた側になっているトピをご覧くださいな。

セクハラの定義は「セクハラされた側が不愉快だと感じた」ですよね。ということは、どんな意図があっても本人が「不愉快だ」と感じたらセクハラ成立です。抗議しても無駄です。

例えば女性に「最近、ダイエットしてすっきりしたじゃない」と褒めても本人が不快だと感じればセクハラだし、本人が喜んでも周囲の（ちょっと太めの）同僚達が不快に感じればやはりセクハラです。トピ主さんは全く同じ事をしたんですよ。男性の苦労がわかりましたね？

もしくは下心あるように思えて不快だったとか、冗談話が尾ひれついて周りに回ってセクハラと受け止められたとか。

陰ではあまりいい評判で無い可能性もありますよね。

信用取り戻すには時間かかると思いますが今後Ｆとその周りの人たちとは極力かかわらないほうがいいかもしれません。

心当たりがそれだけといえるくらいＦに対してだけ言ってたということなので周りや本人はあれ？っと感じたのかもしれません。

課長にはどういったのですか？

からかうといった言葉は具体的にどのようなものだったか聞きましたか？課長も詳細しらないのではないですか？仮に痩せてかっこよくなったねって言葉は褒め言葉ですし。言い方がまずかったなら本人に謝れますしね。太ったときにからかったのが傷ついたのかもしれませんね。

＞女性がセクハラの加害者になることはほとんどあり得ませんし

山ほどあります。
トピ主さんが、不勉強なだけ。
こんな考えだから、

＞セクハラなんて全然納得がいきません。

となるわけです。
そもそも、相手を不愉快にさせておいて｢納得出来ない｣ってどういう頭の構造をしているのでしょうか？
納得するとかしないとかという種類の問題じゃないでしょう。
｢不愉快は不愉快｣それ以上でも以下でもない。
誤解であっても不愉快に変わりはない。

大体、わたしの考えでは会社の中で

＞痩せてカッコよくなったじゃない、良かったね、と何度か言った

こんなこという必要もないし、まして｢何度か｣って完全に嫌味でありイジメでしょう。
転勤でもした方が良いのではないしょうかね？

セクハラの定義ってご存知ですか？
「相手（性別問わず）が嫌だと感じたらセクハラ」なんです。
女性ならほとんどあり得ないと言っていますが、今では増加傾向なんですよ。
部下ができる年次になったというなら、そういった情報もしっかりと調べて
把握するべきだと思います。

仕事上での出来不出来をコメントするならまだしも、
「痩せた」「かっこよくなった」というコメントで、
F君にとってミハルさんは「自分の気にしていたことを言った憎いやつ」と
なってしまったんです。

日頃から、人の容姿について言ってしまう人は特に注意が必要だと思います。
何の問題もなくうまくいっていると（勝手に）思っていても、相手が不愉快に
なることはたくさんあります。
褒めることにも細心の注意を払わなければいけないのが現代社会なのだと
十分に理解しましょう。
今、抗議すれば、あなたの品格が疑われますよ。