私は栄養の専門家でも農業の専門家でもないので、その泡の正体が何の成分か・・・というのはお答えできないのですけど、大豆は水でふやけると泡状のものがでてきます。たとえばお豆腐作りやお味噌作りなどでお豆を煮たりすると、ものすごい量の泡が出てきますよ。（私はアクの一種かな・・・と思っていましたが）

余談ですが、市販のお豆腐のパッケージの「原材料」のところに、国産丸大豆やにがりのほかに、｢消泡剤」というものが載っていることが多くあります。お豆腐を作る行程で、どうしても泡が沢山出るので、泡を消す薬品を仕様するのです。（私は消泡剤を使ったお豆腐は買わないようにしてますが）
泡が出るのは自然現象ですよ。勿論必要以上に長時間水に漬けておくのは論外ですが・・・。

大豆を一晩かけて水で戻すことはよくやっていますし、子供の頃から母がやっているのを見てきましたが、泡がたったという記憶はありません。
どうしてか？私も疑問です・・・

ちなみに私はいつも国産大豆（かなり貴重らしい）を使っていますが、トピ主さんのは国産・外国産どちらでしたか？

うちでも大豆を水につけておくと泡泡します。なんでしょうね？あれ。

スーパーで買おうが、高級デパートで買おうが、はたまた知人からもらった無農薬の大豆でも泡泡します。出自は関係ないみたいね。黒豆でも同じように泡泡しますよ。黒豆なのに白い泡（笑）

気にしないでそのままゆでちゃって、灰汁（あく）と一緒に捨てちゃいます。
でも、実はこの泡に栄養があるなんてことは・・・と考えながら。

大豆や大豆製品に含まる「えぐみ」や苦味の成分だそうです。

血中コレステロールの低下、高脂血症・高血圧・動脈硬化の予防、肥満体質の改善などの働きをするそうです。

サポニンという名前は、「シャボン（せっけん）」に由来するそうで、水に混ぜると泡が立ちます。

大豆サポニンのせいで泡が立ちます。水で戻しただけなら　こいつ（サポニン）のせいです。水溶性なんでしょう、出てきます。もちろん、誰がやっても出てくるし　安全に食べられます！

きれいに取り除いてもよし。
自然のものだとそのままでもよし。

ただし、今の時期常温で長く水に漬けていると、腐る可能性がありますのでお気をつけて。

サポニンと言う成分です。
体には悪影響はありません。こちらのサイトを見ると詳しくのっていますよ。

http://www2.odn.ne.jp/~had26900/constituents/mechan_saponins.htm

大豆サポニンです。抗酸化物質の一種です。
ねこさんが懸念されてる通り、体にいいものです。
煮豆を作る過程で出る泡や灰汁はサポニンやポリフェノール（小豆など）です。

効能は検索等で調べてみてください。

しゃぼんという言葉は、サポニンから来たと聞いた事があります。
ところで、麦茶とか沸かした時、他の容器に移し替えた時、も泡が出ますよね。
あれもサポニンです。

大豆を洗うと泡がたくさん出ますね。
これは大豆にサポニンという成分が多く含まれているからです。
サポニンは、体に悪いコレステロールや中性脂肪を制したり、血液の酸化を防ぐ力があるといわれています。
2月に仕込んだ手前味噌が今、冷たい風の通る床下で熟成中です。