高級旅館となると、食事も豪華になりますから、一泊三万円ってのは少し難しい。

三万五千円くらいを最低料金として、これに夕食時の酒代を追加すると、一泊四万円以上を見ておいた方が良いですね。

箱根の強羅等は五万円からになります。
景色のよい離れや広めの部屋だとその上を行きます。
なかなか庶民には辛い金額ですね。

　伊豆や箱根はメジャーすぎるので除外しました。

　初日は山梨県甲州西山温泉「慶雲館」はどうでしょう。
　東京からなら3時間ちょっとです。
　途中富士宮で「富士宮やきそば」を食べて行く事もできます。
　山奥の1軒宿で山間にぽつんと建つ純和風旅館ですが、数年前に改装されているので綺麗です。
　数年前に「世界最古の旅館」としてギネス認定されました。
　とにかく湯量が豊富で部屋のお風呂のお湯も源泉掛け流しです。
　数年前に私が行った時は、東京ナンバーの高級車が並んでいました。
　携帯やスマホは電波が入らないかも。

　2泊目は長野県扉温泉「明神館」はどうでしょう。
　ここはお料理が有名で、モダン和食・懐石・フレンチとチョイスできるのですが、料理目当てで3泊する方も多いです。
　慶雲館から3時間30分ほどです。
　ちょっと足を伸ばして戸隠でそばを食べることも可能です。
　立ったまま入浴できる「立ち湯」が有名です。
　夕食前はロビーラウンジでアルコールなどのドリンクが無料でサービスされます。
　

９月だから温泉目当てではないですかね？
オトナの…と言うと真っ先に浮かんだのですが。

あとやはり温泉ですが、WA亭・風こみちもオススメです。

いいですね。
高級旅館でゆったり過ごす夫婦旅行

私のおススメは、
山形にあるホテルで、おいしい米沢牛のいただける、時の宿すみれ、です。

松島にある、松島佐勘もよかったです。

楽しんできてくださいね。

高級旅館で料理が美味しく、部屋数が少ないとなると、予算３万円だと厳しいかな・・。
４万円以内、という事であればオススメ出来る旅館も沢山あります。

３万円以下で、高級旅館ではないけれども部屋数が少なくて料理がそこそこ美味しい宿であれば
「湖山荘の離れ（岩手）」、「山人（岩手）」、「都わすれ（秋田）」、「茜庵（栃木）」
でしょうか。
特に湖山荘の離れは、眺望も素晴らしいので一押しです。

東京からアクセスが良い所はどうしても予算が高くなります。特に伊豆箱根では予算３万だと「雰囲気だけ高級旅館のつもり」な宿に当たる可能性大なので要注意。

私も部屋数が少ない宿は静かでのんびりできて大好きです。

高級旅館かどうかは人それぞれですが、車で丁度良いところでは、那須高原の「なか田」、伊豆高原の「花吹雪」、大洗の「里海邸」がオススメです。

あと、お料理が美味しそうで行ってみたいのが伊豆の「花季」です。

宜しければ、HPなどでみてみて下さい♪

四万温泉の積善館とかでどうでしょうか。湯治場と旅館部分がつながっていて面白い宿でした。
お湯もいいし、料理も美味しかったです。今HP見たら平日だと連泊プランもあって、佳松亭でもトピ主さんの
予算内で納まると思います。