例えば菓子折りをそのまま床にペタンと置いたのでしょうか？
それなら嫌ですけど。

果物のおすそ分けでレジ袋のようなものに入っているなら
重いから床に置いたのかなって感じで
さほど気になりません、
菓子折りでも紙袋に入ってるのなら
たまに床に置く人もいるので気にならないです。
コンビニの小さなレジ袋に入ってるのを置かれるのは嫌かな。

ともかく頂いた時の状況がわからないので
何とも言えませんが。

・和室
・椅子はない。床に座る。
という職場なのでしょうか？

だったらアリです。
例えば茶道などでも「お菓子を手渡し」は原則ありません。
食べ物のお裾分けと言っても、むき出しではありませんよね？
包装されている、容器に入っている、皿や懐紙の上にのせられている、等の状態ですよね？
和風の礼儀作法では、品物をやり取りする場合、手渡しするよりもむしろ丁寧なやり方ですよ。
相手は床に座っていませんでしたか？
床に手をついてお辞儀しませんでしたか？
あなたは立ったままで受けちゃダメですよ。
あなたも床に座って手をついて礼をしなくてはいけませんよ。

テーブルでなく、足元の床？ですか？包装され手提げ紙袋に入ったものなら 別です、仕事の邪魔にならないようにと下に置かれた可能性もあります。

私なら言いますね。
「床に置かないでください。机（テーブル）の上の置いてください」と。

いつでも、それが何であっても（書類でも）
床には置かないでくださいと、その都度言うと思います。

それらは床に置く物ではないからです。
知らないのでは？

その方、普段から書類も床に置くということは、やはり机や椅子を置いていない畳の部屋で仕事をしている図が思い浮かぶのですが…
どういう職種なのかもう少し詳しい説明が欲しいですね。
結婚式場の着付け部門とかですか？

どちらにしても「手を出す」のは、「待ち受けている」ようであまり品の良い行為ではないと思います。