参考の一つになればということで、我が家のケースを書きますね。

福岡市内から雲仙まで車で行くことがあります。
夫が運転しますが、長崎道を通るのは遠いし時間がかかるし疲れるしということで、フェリーを利用します。

この場合、南関ICで降りて玉名の長洲港から多比良港へ行くフェリーに乗ります。
島原行のフェリーは熊本から島原港へ行く航路もありますが、私は利用したことがありません。

フェリーに乗船している間は運転手の骨休めになりますし、船内でコーヒーを飲みながらちょっとした船旅気分も味わえます。

トピ主さんの場合は、我が家とは逆になりますね。
熊本ICもしくは南関ICから九州自動車道へ入り大分道へ入る道のりは、さほど無謀とは思えません。

細かな旅行の行程が分からないので何とも言えませんが、フェリーに乗るのはありだと思います。

他の方のレスも参考に、良い旅ができることをお祈りします。

長崎から、島原へ行くのには一般道利用だと、かなり時間を食います。
日中移動だとなお時間を要すると思います。

私だったら、大分道でのんびり周囲の景色を堪能しつつ、ドライブします。

にゃんこさんのおっしゃるとおり、長洲港から南関IC（熊本より南関、どうせ北へ鳥栖へ行くのでしょう？）はそう大変ではないと思うけど、一時間弱かかります。

ただ、長崎から島原へ行くのがどれくらい時間がかかるのか、結構かかりそうな気がします。（ここは、見当がつかない）

子供の頃にそのフェリーに乗ったときは、イルカが並走し、トビウオが飛んできれいでした。

イメージとしては、フェリー使わない場合より、長崎から島原へ行く分の時間が余計にかかる感じかな。

長崎市からたいら港まで、一時間半くらいだそうです。

調べてみて。

■長崎から　国道251号線～雲仙グリーンロード経由～島原港

この間、約90分　（グリーンロードは農業用に整備された走り良い道路です。諫早からグリーンロード経由で島原港へと旅行で走ったことがある。観光的には良い。）

■島原港～熊本港　フェリー（オーシャンアロー）30分

（上記のグリーンロードから道なりで、すぐにフェリー乗り場がある。）
（オーシャンフェリーは30分間。カモメがたくさん船尾に追いかけてきて、餌をやれたりして楽しめる。）

あとはオーシャンアローの便数ですが、ネットで調べてみてください。（約２時間前後？の間隔のようです。）この接続次第で、掛かる時間が大分変わってくる。

■夏なら、夜7時ころまで明るいので、昼頃に長崎出発でも、島原からフェリーで湯布院まで行ける気がしますが、冬で5時過ぎで日没の時期なら、湯布院辺りは日没後～夜かも。

大分道は山中なので、初めて行って、暗くなってから湯布院辺りに分岐するのは不安かと思います。

それから、大分道は、3月までなら、降(積）雪や、雪で通行止めが普通にありえますよ。
4月初旬でも、降雪・高速道の通行止めの可能性あります。

大分道で、通行止めで下道に降りたら、深い山中です。

観光で初めて運転して行くなら
明るい時間に目的地に着くことをお勧めします。

鳥栖を中心に周囲の高速道路は、雪が多いところです。九州だから暖かいと思って行くと、驚きますよ。その時の気象状況によっては、結構な雪が降り積もります。

気象にご注意を。

福岡～太宰府間は無駄に車線が多くて、天満宮前は車は邪魔で、天神から西鉄電車で太宰府に行った方がずっとよいです。電車の方が速いですよ。
空港も地下鉄ですぐなので、福岡では車は要りません。

多比良から阿蘇抜けるのは有りかもしれませんが、フェリーの時間次第ですね。

展望台に行っても暗かったら意味ないですし。

山並みが観音様が横たわっているように見えるので、寝観音といわれているところを見てほしいです。

由布院の次の日に、阿蘇、熊本経由で福岡行けると思います。

阿蘇も熊本市もまんがワンピースのキャラクターの像があるんですよ。

福岡（天神）から太宰府は、西鉄電車で二日市乗り換えで30分かからないくらいかなと思います。
電車が便利です。

４日目が最終日でよろしいでしょうか。

福岡では電車を押される方が多いのですね。

せっかく太宰府まで足を伸ばすんだから、太宰府政庁跡や坂本八幡宮や水城跡も見ていただきたいです。

なのでレンタカーかタクシーをお勧めします。

太宰府から空港までは車ですぐですし。

電車だと帰り空港までのアクセスが非常に悪いです。

やはり太宰府からはタクシーかバス、もしくはレンタカーですかね。

良い旅を。