通勤時間・片道90分の保育園選び

ご意見をお願いします。

現在育児休業中の会社員です。
来年2月に育児休業終了し復職予定ですが、保育園の選択で迷っています。
出産前の通勤および勤務状態は以下の通りです。

・夫婦で同じ会社に勤務。
・通勤時間は片道約90分。
・基本的に夫婦同乗で車通勤。電車利用せざるをえない日もある。
・都心から郊外への通勤のため通勤ラッシュは激しくない。
・勤務時間は8:30-17:30。実際は18:30頃まで残業有り。
・残業により夫婦で終業時間が異なる場合もある。
・6:40頃家を出て、帰宅途中に外食し、20:30頃帰宅。

この場合、会社近くの保育園と自宅近くの保育園、どちらに預けるのが良いでしょうか。

出産前は、預けている間に何かあっても、すぐに駆けつけられないようでは困ると思い、会社近く（といっても、車で15分弱）の認証保育所を予約しました。
ただ、往復3時間の車通園、起床時間および朝食時間の早さ（多分5時半位に食べ始めないと、出発できないでしょう）、夕食は外食になる可能性が高いことなどが、1歳になったばかりの子にストレスにならないかと、今更ながら心配になってきました。
また、電車を利用する日は、長時間、おとなしくできるかという心配もあります。
ベビーカー嫌いなので抱っこ紐利用になる点も、お互いに、しんどそうです。

自宅近くの区立保育園に預ける場合は短時間勤務制度を利用する予定ですが、預けている間に何かあった時、迎えに行くまで90分かかる点が不安材料です。
当然、入園できるかどうかという問題がまずありますが…
ちなみに認証保育所からは、4月には入所できるだろうと予約時に言われています。

また、通勤時間の長い方、実際どのように保育園に預けているか経験談を教えていただければ幸いです。
よろしくお願いいたします。