病院と処方箋と薬局

本日、近所の総合病院にかかってきました。
診察を終え、会計を済ませ、処方箋を頂き、すぐ隣にある薬局へ。
しばらく待って薬をもらって帰宅したのですが…。

なんで病院で薬まで出してしまわないんでしょうか？
処方箋を出すことで、病院としては薬分の売り上げをみすみす逃しているようなもの。
患者側としても会計のために２か所に行って、２か所で待ち、２か所で支払い。
面倒なだけです。

個人病院のような小さな病院では診察代も薬代もいっぺんで会計が済むので、私はそちらのほうが好きです。

「医薬分業」という言葉があるのは知っていますが、あまり深い意味合いを感じません。
だって、病院の経営者と隣の薬局の経営者が同じ系列だったりしたら、建物が分かれてるだけで、結局同じ財布にお金が入ります。

処方箋というシステム、病院側にも患者側にもメリットがないような気がするのですが…。
何故分けるのですか？
ご存知の方、ぜひ教えてください。