転職支援会社の利用法について

今年27歳で、最近転職活動を始めた者です。
今、登録している転職支援会社から、
多数の会社へ応募したのが5月のＧＷ明け。

その中の1社(Ａ社)にとても興味があり、
選考が進めば良いなと思っていましたがなかなか合否の連絡が来ません。

ヤキモキしていたとき、
Ａ社のサイトでも多数の人員募集があるのを知り、
かつその転職支援会社にはない課の募集もありました。

自社サイトしか扱っていない課の方が個人的に志望が高く、
エージェントへ、個人で応募して良いかと聞いたところ、
既に推薦して選考に入っているから個人での応募はできない状態です。とのことでした。

その場は承知したんですがその後、他社も含めて選考が進まず
(落ちているのではなく合否の連絡が来ない)、
また連絡ミス等が多く、そのエージェントさんに一抹の不安を感じています。

一番良いのは、エージェントから採用の連絡が来て、
面接時に「御社サイトに募集のあった課にもとても興味がある」と、
言える場があればと思い、

まだましなのがエージェントから近い内に、
不採用でも連絡が来るのならいいのです。
(その後、自分でＡ社サイトより応募すればいいので)

ただ、まだ来ないと待っているうちに、
Ａ社サイトの希望の課の募集が終わってしまい、
その後エージェントより不採用の連絡があったら、
志望している現状さえ、分かってもらえないと思ってしまいます。

ただ、エージェントからはＮＧが出ているし、
個人で応募すると心証が悪いかなとも思いますが、
友達に相談したところ、
エージェントは自分のところから採用が決まって欲しいんだから、
個人で応募しないでって言うに決まってると言われました。

このまま待っていた方が良いのか動いた方が良いのか…
アドバイスお願いします。