転職時のお礼メール

先日転職先が決まり、入社前に面談がありました。
その際、お話を伺った上司から会社のアドレスをもらい、
「何かあれば連絡してください」と言われたので、
取り急ぎ面談のお礼のメールをしようと考えています。

ところが、友達からは、「事務手続き担当（総務）ではない方に、
入社前からわざわざ連絡する必要はないんじゃない？」と言われました。
会社の人間関係がよくわからないうちに、
むやみに異性の上司に連絡する必要はないというのです。

私はお礼ぐらいならかまわないかと思ったのですが、
波風を立てかねないものなのでしょうか？
ささいなことで恐縮ですが、ご意見伺えればと思います。