包丁を研ぐ砥石の修正と目詰まりについて

私は、シャプトンの刃の黒幕の、1000 2000 5000 12000の４種類を所持していて、この砥石で包丁を研いでおります。
包丁を研いでいると、砥石に凹凸ができてくるので、シャプトンの説明書に書いてある通り、1000と2000、1000と5000といった、ともづりして修正しています。

　疑問に思うのですが、違う番手をともづりしてしまうと、違う粒子が入ってしまうのではないかなって思いますが、どうなんでしょうか？

　それと、12000番のような高番手の修正と目詰まりには、どういった道具が必要でしょうか？
　スエヒロの中砥石・仕上げ砥石用の修正砥石一つと、シャプトンの復活砥石一つは持っていますが、修正砥石と復活砥石を、この4種類の砥石に併用しても大丈夫でしょうか？
　併用するということは、違う粒子のものが付着してしまうと思います。
　それとも、タワシなどで、違う砥石にするたびに、綺麗にすれば問題ないのでしょうか？
　最近、5000番と120000番を購入したのですが、研ぐたびに、砥石が黒くなり、ツルツルしてしまい、目詰まりしていそうな気がします。

　純三河白名倉砥石というので修正している方もいますが、どんな道具がいいのかわからない状態です。

　よろしくお願いします。