バイトについて

はじめまして、みりんと申します。 私は大学4年の就活を終えたものです。 大学1年生の頃から現在まで働いているバイト先があるのですが、辞めたいと考えています。 現在まで働いていると書きましたが、実際には就活などがあり、また家からバイト先まで片道1時間半(電車)かかるため2018年の4月から一度も行きませんでした。 約5ヶ月行ってない状態で、辞めたと思われていてもおかしくないのですが、1番偉い方は私が就活を終えたら戻ってくると思っていたようです。 私はもうバイトに入りたくないので、どのようにして辞めますと伝えようかと考えていて、上司のLINEを知っているので、LINEで伝えようと思います。電話は？とかバイトに先行けば？と思われるかもしれませんが、上司は仕事の都合で空いてる時間が少ないです。また直接顔を見ると辞めると言い出せなくて、3年間ズルズルと続けてきてしまいました。 辞めたい理由としては3年間やってきたとはいうものの、週2入るか入らないか程度で、夜まで入ることも出来ず、稼ぐのには効率的に良くないからです。また勤務中はずっと立ちっぱなしであり、座ることができません。そのため昔痛めた腰が痛くなってしまいます。腰のことは伝えてあったのですが、気にされていませんでした。他にもいくつか辞めたい理由があるのですが、ここまでで…。 出てないならそのままフェードアウトしちゃえば？と言われることもあるのですが、バイト先の規模はかなり少人数で、上司にもたくさんお世話になったと思っています。なので辞めることを伝えてから、お菓子か何かのお礼を持って挨拶に行こうと思っています。 もし他に良い案があれば教えていただきたいです。 また何かアドバイスをお願い致します。