空き家民家の内部がゴミや動物のフンな場合

こんにちは。 まれなケースですが。 ふつうは、民家にタヌキやハクビシンが出没した場合は。。。 その日のうちに猟友会がとんできて退治となるそうです。 でも、そのような早急な対策がなされてないときは、空き家は獣の住家となり荒れ放題となります。 家ごと獣のふんで埋め尽くされている空き家は衛生上、あんまりよろしくないんじゃないかと。。。 それでも、持ち主が解体、撤去しない場合、条例違反にはならないのですか？ 道路にはみだしているわけではなくて、家の内部のことだから、堆肥みたいなかんじでＯＫでしょうか？ 気にしすぎでしょうか？